Please activate JavaScript!
Please install Adobe Flash Player, click here for download

2013|14 Jahresbericht Fraunhofer IGB

81 Priv.-Doz. Dr. Susanne Bailer Telefon +49 711 970-4180 susanne.bailer@igb.fraunhofer.de Priv.-Doz. Dr. Steffen Rupp Telefon +49 711 970-4045 steffen.rupp@igb.fraunhofer.de Kontakt Förderung Wir danken dem Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) für die Förderung des Projekts »FYI – Fungi Yeast Identifi- cation«, Förderkennzeichen 01EZ1113F. Projektpartner Euroimmun Medizinische Labordiagnostika AG, Lübeck (Koordi- nator)  |  Herz- und Diabeteszentrum NRW, Bad Oeynhausen  |   IGVP, Universität Stuttgart  |  Multi Channel Systems MCS GmbH, Reutlingen  |  Robert Bosch GmbH, Gerlingen Ergebnisse Am IGVP konnten bisher 45 relevante Hefe- und Schimmel- pilzerreger, darunter Candida spp. oder Aspergillus spp., ein- deutig und mit hoher Sensitivität mittels neu entwickelter PCR-Systeme und DNA-Sonden auf Microarrays nachgewiesen werden. Dazu wurden PCR-Systeme für mehrere Gene ent- worfen, die zwischen den Spezies hochkonservierte Bereiche aufweisen, gleichzeitig aber ausreichend variabel sind, um eine Diskriminierung über DNA-Sonden zu erlauben. Der Zeit- bedarf von der Isolation der DNA bis zum Nachweis auf dem Array liegt gegenwärtig bei 3 – 4 Stunden. Parallel dazu wur- den von unseren Projektpartnern LOC-Systeme entwickelt, in die gegenwärtig die von uns entwickelten DNA-Microarrays integriert werden. LOC-kompatible Aufschlussverfahren wer- den hier gemeinsam mit den Partnern für unterschiedliche Patientenproben, wie z. B. respiratorische Sekrete für die Dia- gnostik von Patienten mit Mukoviszidose (zystische Fibrose), erarbeitet. Dabei kommen Einmalkartuschen zur flexiblen und kostengünstigen Ausgestaltung des Systems zum Einsatz. Ausblick Als Mini-Labor verbindet das LOC die Probenvorbereitung mit der schnellen molekularbiologischen Diagnostik von Hefe- und Schimmelpilzen direkt auf dem Chip – mit hoher Spezifität und Sensitivität. Damit kann es den Arzt bei der Diagnosestel- lung unterstützen und eine zeitnahe, adäquate Therapieeinlei- tung bzw. Therapieanpassung ermöglichen. Das LOC-System wird so ausgelegt, dass es auf weitere Probenmaterialien, bei- spielsweise Biopsiematerial oder bakterielle Erreger, angepasst werden kann. Das LOC wird nach Fertigstellung durch die Partner in den Markt eingeführt. 1 Candida spp., gefährliche Erreger für immunsupprimierte Patienten. 2 DNA-Microarray für die Routinediagnostik. 3 Zeit- und Prozessschema für die Erregerdetektion. 3 Patientenprobe (Respiratorische Sekrete, Blut) t = 0 h Isolierung und Aufreinigung fungaler DNA t = 0,5 h Amplifikation diagnostischer Zielregionen t = 3 h 1 2 3 4 5 MICROARRAY Hybridisierung fluoreszenzmarkierter PCR-Produkte t = 4 h Auslesen der speziesspezifischen Fluoreszenzsignale t = 5 h

Übersicht